佛珠是弘法最为方便的法器，所以历来大德高僧莫不巧用佛珠。在经典当中特别强调，持用不同质料的佛珠，其念诵的功德利益，也有胜劣的差异。

　　前面讲过，佛珠可分为三个种类，即持珠、佩珠、挂珠，而一般的念佛者，大多选用持珠。持珠的姿势，亦可分为二种，单手持珠与双手持。单手持珠，大多用于站立、经行的时候；而双手持珠则是打坐时经常采用的姿势。其方法是将佛珠置于两手之间，呈交叉状，把母珠放在一侧，掐捻一周，回至原处即可。其实，根据《佛像图鉴》一书记载，历来大德高僧手持佛珠的姿势皆无定法，左手、右手、单手、双手、提高、垂下、平胸、齐膝，各种动作都有，但求其“方便”而已，所以我们也就不必强求特定的持珠方法了。

　　在持珠的过程中，经常有人会遇到要不要跨过“佛头”(母珠)这类问题。因为在经典中曾有：
　　珠表菩萨之胜果，于中间绝为断漏。
　　绳线贯串表观音，母珠以表无量寿。
　　慎莫蓦过越法罪，皆由念珠积功德。

　　经有记载，故而才有此一说。假如念诵者，纯以佛珠作为记数的工具，则不必把母珠和隔珠计算在内，念诵时轻轻捻过便是。如是念诵的人，除了把佛珠当作精进、记数的工具外，还希望藉着它来体悟更多佛理的话，当手捏到隔珠的时候，可用“佛、法、僧”三宝，或“戒、定、慧”三学来观想，当手掐到母珠的时候，也同样可以观想佛的相好光明，同时再逆时针朝相反方向捏念，即可解决此类问题了。

　　佛珠除了拿在手中起念诵记数的作用以外，还可以挂在颈部充当挂珠，或缠绕在手臂上起到佩珠的作用，这些都是具有深刻含义的：
　　二手持珠当心上，静虑离念心专注，
　　本尊瑜伽心一境，皆得成就理事法。
　　设安顶髻或挂身，或安颈上及安臂，
　　所说言论成念诵，以此念诵净三业。
　　由安顶髻净无间，由带颈上净四重，
　　手持臂上除众罪，能令行人速清净。
　　若修真言陀罗尼，念诸如来菩萨名，
　　当获无量胜功德，所求胜愿皆成就。

　　另外，密教的经典对掐捻佛珠的指法也有详细规定。从五部而言，《摄真实经》中记载：佛部以右手拇指与食指掐之，金刚部以右手拇指与中指，宝部以右手拇指与无名指，莲花部以右手拇指与小指，羯磨部以右手拇指与其余四指合捻之。从三部而言，《苏悉地经》中记载：佛部以右手拇指与其余四指的指尖相合，中指与小指直立，食指略屈附于中指中节以掐之；莲花部以拇指与中指指尖相合，舒展其余三指而掐之；金刚部以拇指与食指指尖相合，舒展其余三指而掐之。