2005年10月4日,在石室禅院药师专修法会期间,天空出现三道彩虹,一端凝聚成观世音菩萨圣像就在现琉璃塔所在的位置(当时只是一片空地),久久方散去。在西方三圣与东方八大菩萨中都有观世音菩萨,往生东方净土和中品以上往生西方净土可见到观世音菩萨,修药师还是弥陀净土时有观世音菩萨显现。所以后来禅院在此修建琉璃宝塔。石室禅院琉璃宝塔又称观音功德堂,为六角宝塔,共七层。塔第一层主供千手观音菩萨、地藏王菩萨,并放置三宝弟子历代祖先功德牌位及祈福消灾的怨亲债主牌位。